上海工商公司注册办理流程如下：

1、名称登记（核名，3-5个工作日）领取市工商行政管理局名称预先核准通知书后，区工商行政管理局打印名称预先核准通知书，收到企业名称预先核准通知书有效期为半年，半年内未办理工商登记的，可以延期。提交《企业名称预先核准申请书》，并附法定股东身份证复印件。委托代理人办理的，应当提供代理人身份证复印件的正面和负面。

2、国内登记（申请营业执照，5个工作日）名称批准后，需填写《公司登记备案申请书》、公司章程《公司章程》、股东会决议《股东会决议》、《指定代表授权委托书》、《董事法人监事任免书》、《总经理任免书》、等材料，提供房屋租赁合同和产权复印件，提交工商行政管理局，申请营业执照。相关材料可在工商行政管理局大厅领取。

3、加盖营业执照后，到工商局指定的加盖地点加盖公章、法人章、合同章、财务章、发票章。

4、企业开户（10个工作日内）应携带公司全套印章、营业执照原件和法人身份证原件到银行开立基本账户。受理企业开户申请后，向中国人民银行提交企业开户申请材料，为企业设立基本账户和账户。自基本账户成立之日起，账户可以收取款项，企业可以办理对外支付业务。

5、核定税种需提供财务信息和法人身份证信息，核定税种；后期根据公司业务需要购买发票。公司需要开具增值税专用发票的，还需要申请一般纳税人资格。

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